本文记录在Ubuntu 22.04中安装AFNI 24.2的过程。
分类： MRI
在Ubuntu 22.04中安装FSL 6.0.7
本文记录在Ubuntu 22.04中安装FSL 6.0.7的过程。
使用LQT分析脑损伤数据
本文介绍LQT（Lesion Quantification Toolkit）的基本用法。LQT是一个MATLAB工具包，主要用于度量局部脑损伤引起的白质失连接（disconnection）。
使用fsbrain对FreeSurfer数据进行读写和可视化
本文介绍使用R环境下的fsbrain包对FreeSurfer格式的数据进行读写和可视化的基本方法。
使用BrainSMASH进行空间相关
在进行不同脑图间的关联分析的时候，需要考虑到脑图本身的空间自相关性（spatial autocorrelation）。这里介绍使用Python环境下的BrainSMASH包进行空间相关的基本方法。
使用abagen包提取AHBA基因表达数据
介绍使用Python环境下abagen包提取AHBA（Allen Human Brain Atlas）基因表达数据的基本方法。
DARTEL工具包的基本用法
使用SPM12里的Dartel Tools构建组水平灰白质模板、实现个体与模板之间的配准和相互转换等。
CAT拾遗3
如何在CAT12中使用自定义的组织概率图谱（Tissue Probability Maps，TPM）和DARTEL模板进行分析。