ANTs提供了一个基于volume的皮层厚度分析流程（相比于FreeSurfer基于surface的分析流程），这里记录一下如何使用ANTs计算和比较两组被试的大脑皮层厚度。
作者： Alex
使用ANTs进行组织分割
组织分割就是将MRI图像划分成不同的成分，比如灰质、白质和脑脊液等。使用ANTs进行组织分割，主要包含三个步骤：颅骨剥离、配准和组织分割。并将ANTs和FSL-FAST的分割结果进行简单比较。
使用FSL进行multi-band时间层校正
使用multi-band序列扫描的功能像是否需要进行时间层校正也许仍是一件有争议的事情。这里介绍使用FSL的slicetimer进行mult-band时间层校正的方法。
使用CAT进行VBM分析
CAT (Computational Anatomy Toolbox) 是一个基于SPM (Statistical Parametric Mapping) 的Matlab工具包，这里记录一下使用CAT进行VBM分析的方法。
使用FSL进行VBM分析
FSL提供了一个进行VBM（Voxel-Based Morphometry）分析的流程，这里重复一下FSL官网的教程；另外，使用volBrain得到的颅骨剥离的结果替换FSL相应的部分，看看结果会如何变化。
使用GIFT进行独立成分分析
GIFT和Melodic是进行独立成分分析（ICA）最常用的两个工具。相比于Melodic，GIFT的ICA算法更丰富。另外，GIFT基于Matlab，方便在Windows系统上使用。这里介绍如何使用GIFT的图形界面和脚本进行独立成分分析，这些方法来自于GIFT官方文档。
将Melodic图形界面转换成Bash脚本
使用Melodic的图形界面可以方便地进行功能像预处理和独立成分分析，但是图形界面的流程是固定的，随着各种新的分析工具的出现，有必要替换或增减整个流程中的某些步骤。将图形界面转换成对应的Bash脚本就是便于根据自己的需求来调整整个分析流程。这里介绍用report_log.html和featlib.tcl两个文件将图形界面还原成脚本。
学习Hello Dolly插件
通过安装插件，可以拓展WordPress网站的功能。Hello Dolly是WordPress默认安装的一个插件。Hello Dolly插件的功能是在WordPress后台的每个页面随机显示Hello Dolly的一句歌词。学习Hello Dolly可以了解如何写一个简单的插件。