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Alex的学习笔记

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作者: Alex

使用FSLeyes进行可视化

作者 Alex发布于 2020-10-312023-09-10分类 MRI标签 visualization使用FSLeyes进行可视化有 2 条评论

使用FSLeyes进行可视化的一些小技巧,包括设置背景颜色、设置colormap和colorbar、可视化分区模板、查看脑区信息、查看时间序列、显示种子点功能连接、查看图像信息、设置显示空间、关联显示、保存图片。

磁共振成像基本原理

作者 Alex发布于 2020-10-062023-09-07分类 MRI标签 contrast、modality于磁共振成像基本原理留下评论

尝试总结一下常见的磁共振脑成像模态(T1-weighted/BOLD/Diffusion-weighted)的基本原理。

MNI152和fsaverage相互转换

作者 Alex发布于 2020-09-112023-09-06分类 MRI标签 standard space于MNI152和fsaverage相互转换留下评论

使用RF-ANTs方法实现MNI152和fsaverage之间的相互转换。

磁共振脑成像数据分析:从陌生到熟悉

作者 Alex发布于 2020-08-242023-09-02分类 MRI标签 data analysis、MRI、neuroimaging磁共振脑成像数据分析:从陌生到熟悉有 1 条评论

总结自己在学习磁共振(MRI)脑成像数据分析中的一些经验。

在Mac本地安装WordPress

作者 Alex发布于 2020-08-102023-07-13分类 Web标签 blog于在Mac本地安装WordPress留下评论

使用MAMP在Mac安装WordPress。

使用AFNI和FSL实现一些常用小功能

作者 Alex发布于 2020-08-082023-09-01分类 MRI标签 AFNI、FSL于使用AFNI和FSL实现一些常用小功能留下评论

总结一下如何使用AFNI和FSL实现一些常用小功能,包括将图像转换成Z分数、提取部分时间点数据、计算图像间的空间相关、生成截图、计算静息态指标以及提取ROI统计值。

如何进行FDR校正

作者 Alex发布于 2020-08-042023-08-30分类 R标签 multiple comparison correction于如何进行FDR校正留下评论

FDR(False Discovery Rate)校正是一种常用的多重比较校正的方法,本文总结一下FDR校正的基本步骤以及如何在R和Matlab中进行FDR校正。

使用ggplot2进行数据可视化

作者 Alex发布于 2020-06-072023-08-29分类 R标签 visualization于使用ggplot2进行数据可视化留下评论

使用R中的ggplot2包进行常见的数据可视化的方法,包括箱线图、散点图、柱状图等。

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