总结在MRI脑成像中关于坐标系统的一些概念。
分类: MRI
使用FSLeyes进行可视化
使用FSLeyes进行可视化的一些小技巧,包括设置背景颜色、设置colormap和colorbar、可视化分区模板、查看脑区信息、查看时间序列、显示种子点功能连接、查看图像信息、设置显示空间、关联显示、保存图片。
磁共振成像基本原理
尝试总结一下常见的磁共振脑成像模态(T1-weighted/BOLD/Diffusion-weighted)的基本原理。
MNI152和fsaverage相互转换
使用RF-ANTs方法实现MNI152和fsaverage之间的相互转换。
磁共振脑成像数据分析:从陌生到熟悉
总结自己在学习磁共振(MRI)脑成像数据分析中的一些经验。
使用AFNI和FSL实现一些常用小功能
总结一下如何使用AFNI和FSL实现一些常用小功能,包括将图像转换成Z分数、提取部分时间点数据、计算图像间的空间相关、生成截图、计算静息态指标以及提取ROI统计值。
使用FSL自动报告脑区结果
在网上看到一个Bash脚本,可以自动报告脑区结果,这里学习一下实现过程。
FreeSurfer拾遗
总结使用FreeSurfer分析T1结构像的一些小技巧,包括提取分区指标、刻画皮层折叠特征、ROI分析结果可视化、追踪数据分析等。