本文介绍如何使用GNU Parallel进行多个被试的FreeSurfer并行计算。
标签: FreeSurfer
使用fsbrain对FreeSurfer数据进行读写和可视化
本文介绍使用R环境下的fsbrain包对FreeSurfer格式的数据进行读写和可视化的基本方法。
使用freeview批量生成图片
freeview可以方便地对体积和皮层文件进行可视化。在实际运用中,往往需要查看大量被试的数据,如果每个被试手动进行可视化,会耗费大量时间。一个解决方案是,批量生成所有被试的图片,然后查看这些图片即可。这里就介绍如何批量生成图片的方法。
recon-all步骤解析
FreeSurfer提供的recon-all脚本包含很多处理步骤,根据我自己的了解介绍其中每个步骤的选项和意义。这些步骤、解释以及具体选项可以在FreeSurfer的ReconAllTable里找到。