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Alex的学习笔记

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分类: MRI

使用FSLeyes进行可视化

作者 Alex发布于 2020-10-312023-09-10分类 MRI标签 visualization使用FSLeyes进行可视化有 2 条评论

使用FSLeyes进行可视化的一些小技巧,包括设置背景颜色、设置colormap和colorbar、可视化分区模板、查看脑区信息、查看时间序列、显示种子点功能连接、查看图像信息、设置显示空间、关联显示、保存图片。

磁共振成像基本原理

作者 Alex发布于 2020-10-062023-09-07分类 MRI标签 contrast、modality于磁共振成像基本原理留下评论

尝试总结一下常见的磁共振脑成像模态(T1-weighted/BOLD/Diffusion-weighted)的基本原理。

MNI152和fsaverage相互转换

作者 Alex发布于 2020-09-112023-09-06分类 MRI标签 standard space于MNI152和fsaverage相互转换留下评论

使用RF-ANTs方法实现MNI152和fsaverage之间的相互转换。

磁共振脑成像数据分析:从陌生到熟悉

作者 Alex发布于 2020-08-242023-09-02分类 MRI标签 data analysis、MRI、neuroimaging磁共振脑成像数据分析:从陌生到熟悉有 1 条评论

总结自己在学习磁共振(MRI)脑成像数据分析中的一些经验。

使用AFNI和FSL实现一些常用小功能

作者 Alex发布于 2020-08-082023-09-01分类 MRI标签 AFNI、FSL于使用AFNI和FSL实现一些常用小功能留下评论

总结一下如何使用AFNI和FSL实现一些常用小功能,包括将图像转换成Z分数、提取部分时间点数据、计算图像间的空间相关、生成截图、计算静息态指标以及提取ROI统计值。

使用FSL自动报告脑区结果

作者 Alex发布于 2020-04-252023-08-24分类 MRI标签 cluster于使用FSL自动报告脑区结果留下评论

在网上看到一个Bash脚本,可以自动报告脑区结果,这里学习一下实现过程。

FreeSurfer拾遗

作者 Alex发布于 2020-04-182023-08-22分类 MRI标签 cortical folding、parcellation于FreeSurfer拾遗留下评论

总结使用FreeSurfer分析T1结构像的一些小技巧,包括提取分区指标、刻画皮层折叠特征、ROI分析结果可视化、追踪数据分析等。

使用FreeSurfer分析T1结构像数据

作者 Alex发布于 2019-11-092023-08-22分类 MRI标签 surface-based Morphometry使用FreeSurfer分析T1结构像数据有 6 条评论

总结使用FreeSurfer分析T1结构像数据的基本步骤,所有内容来自于FreeSurfer的官方教程。

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