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Alex的学习笔记

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分类: MRI

磁共振脑成像数据分析:从陌生到熟悉

作者 Alex发布于 2020-08-242023-09-02分类 MRI标签 data analysis、MRI、neuroimaging磁共振脑成像数据分析:从陌生到熟悉有 1 条评论

总结自己在学习磁共振(MRI)脑成像数据分析中的一些经验。

使用AFNI和FSL实现一些常用小功能

作者 Alex发布于 2020-08-082023-09-01分类 MRI标签 AFNI、FSL于使用AFNI和FSL实现一些常用小功能留下评论

总结一下如何使用AFNI和FSL实现一些常用小功能,包括将图像转换成Z分数、提取部分时间点数据、计算图像间的空间相关、生成截图、计算静息态指标以及提取ROI统计值。

使用FSL自动报告脑区结果

作者 Alex发布于 2020-04-252023-08-24分类 MRI标签 cluster于使用FSL自动报告脑区结果留下评论

在网上看到一个Bash脚本,可以自动报告脑区结果,这里学习一下实现过程。

FreeSurfer拾遗

作者 Alex发布于 2020-04-182023-08-22分类 MRI标签 cortical folding、parcellation于FreeSurfer拾遗留下评论

总结使用FreeSurfer分析T1结构像的一些小技巧,包括提取分区指标、刻画皮层折叠特征、ROI分析结果可视化、追踪数据分析等。

使用FreeSurfer分析T1结构像数据

作者 Alex发布于 2019-11-092023-08-22分类 MRI标签 surface-based Morphometry使用FreeSurfer分析T1结构像数据有 6 条评论

总结使用FreeSurfer分析T1结构像数据的基本步骤,所有内容来自于FreeSurfer的官方教程。

PANDA实现细节

作者 Alex发布于 2019-10-112023-08-20分类 MRI标签 Diffusion toolkit、DWI、FSL于PANDA实现细节留下评论

通过学习PANDA的函数,了解DWI数据处理的细节。

使用TBSS分析DWI数据

作者 Alex发布于 2019-09-022023-08-19分类 MRI标签 diffusion、fractional anisotropy使用TBSS分析DWI数据有 2 条评论

使用FSL进行基于纤维束骨架的方法(Tract-Based Spatial Statistics, TBSS)分析弥散加权MRI数据。

使用PANDA分析DWI数据

作者 Alex发布于 2019-08-222023-08-18分类 MRI标签 DTI、TBSS、Tractography于使用PANDA分析DWI数据留下评论

PANDA是一个基于Matlab的分析DWI数据的工具包,可以对DTI指标进行基于ROI和TBSS分析,以及进行基于确定性或概率性纤维追踪的结构连接分析。

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