2017 年 – 第 3 页 – Alex的学习笔记

使用BET对结构像进行颅骨剥离

颅骨剥离是fMRI数据分析中常见的步骤，这里介绍了结构像和功能像的区别、颅骨剥离的作用、使用Bet命令进行颅骨剥离以及如何检查颅骨剥离的效果。

fMRI数据分析的第一步往往是将格式为dcm或IMA的原始数据转换成nii或nii.gz的格式。这里介绍如何使用MRIcron里的dcm2nii命令将dcm文件转换成nii格式，也包括如何安装MRIcron。

AFNI和FSL是两款比较常用的fMRI数据分析软件，这里介绍一下如何在Ubuntu系统下安装AFNI和FSL，完全按照软件官网教程的步骤来安装，尽可能确保正确的安装了最新版的软件。

在fMRI数据处理中，常需要编辑脚本。Vim是一款常用的文本编辑器，特别是需要远程登录服务器处理数据的时候。这里介绍Vim编辑器的基本用法，包括新建、编辑、保存、退出脚本以及查找功能等。

学习一些 Linux 命令行的基本知识对于安装和使用fMRI数据分析软件是必须的。这里介绍关于命令行的4个重要的概念，即什么是命令行、命令、路径变量和SHELL。

不少fMRI数据分析软件需要在Linux系统中运行。这里介绍一下如何通过VirtualBox虚拟机的方式来安装Ubuntu系统。