您好，不好意思打扰您了。 我有个问题想咨询下您。我做的是ALE元分析，我先使用的是cluster level FWE矫正（设置时cluster level FWE 0.001, threshold permutation 1000，p value 0.05, ），然后有的cluster很大差不多上万立方毫米，然后我又试了下未校正p值（p=0.001，min volume=300），这次的结果就是差不多2,3千立方毫米，小点的就几百立方毫米。我就很困惑，为啥用了矫正结果很大，没用矫正结果却很小，是不是那里有问题。 回复
因为你在做cluster-level校正的时候，(voxel-level) p value设置太宽松了。如果你想在未校正p=0.001的基础上再做cluster-level的校正，应该把p value设置为0.001。 回复
您好，我想问一下用GingerALE软件做了元分析之后，做结果可视化的话，是对输出结果中的阈值化图像（文件后缀为.._C05_5k_ALE.nii）进行最终的可视化吗？可以基于python进行可视化吗？之前是用matlab中的brainnet viewer进行的绘图，现在想转用python这样。 另外，看Eickhoff（2016）的文章中建议ALE元分析最好有17个实验，但是我的研究主题纳入的实验比较少，这种情况下做出的元分析结果可以吗？ 打扰您了，非常感谢！！ 回复
（1）我觉得对卡阈值后的任何图像进行可视化都是可以的，比如卡阈值后的ALE图像，团块的mask或者P值图像。 （2）可以使用任何可视化工具进行可视化。 （3）虽然我没有读过Eickhoff这篇文献，但是我觉得应该不会有这样的硬性要求，只不过纳入的研究多一点，统计力可能强一点。你可以看看Eickhoff有没有给出什么具有说服力的理由，为什么刚好是17篇。 回复
您好，不好意思打扰您了。
我有个问题想咨询下您。我做的是ALE元分析，我先使用的是cluster level FWE矫正（设置时cluster level FWE 0.001, threshold permutation 1000，p value 0.05, ），然后有的cluster很大差不多上万立方毫米，然后我又试了下未校正p值（p=0.001，min volume=300），这次的结果就是差不多2,3千立方毫米，小点的就几百立方毫米。我就很困惑，为啥用了矫正结果很大，没用矫正结果却很小，是不是那里有问题。
因为你在做cluster-level校正的时候，(voxel-level) p value设置太宽松了。如果你想在未校正p=0.001的基础上再做cluster-level的校正，应该把p value设置为0.001。
您好，我想问一下用GingerALE软件做了元分析之后，做结果可视化的话，是对输出结果中的阈值化图像（文件后缀为.._C05_5k_ALE.nii）进行最终的可视化吗？可以基于python进行可视化吗？之前是用matlab中的brainnet viewer进行的绘图，现在想转用python这样。
另外，看Eickhoff（2016）的文章中建议ALE元分析最好有17个实验，但是我的研究主题纳入的实验比较少，这种情况下做出的元分析结果可以吗？
打扰您了，非常感谢！！
（1）我觉得对卡阈值后的任何图像进行可视化都是可以的，比如卡阈值后的ALE图像，团块的mask或者P值图像。
（2）可以使用任何可视化工具进行可视化。
（3）虽然我没有读过Eickhoff这篇文献，但是我觉得应该不会有这样的硬性要求，只不过纳入的研究多一点，统计力可能强一点。你可以看看Eickhoff有没有给出什么具有说服力的理由，为什么刚好是17篇。
您好，我想请问当我用ALE方法去探究两组人群GMV显著差异的坐标时，GMV上升和下降的坐标点同时纳入ALE，那最后ALE出来的结果我怎么判断是显著增加还是降低的区域呢？
对于ALE，需要分别做上升和下降的分析，不能一次同时纳入两个方向的坐标点。