使用ANTs进行MRI图像配准 除了原始数据本身的质量,配准大概是fMRI预处理中最影响数据质量的步骤吧。这里主要介绍如何使用ANTs(Advanced Normalization Tools)进行结构像和功能像的配准,也包括如何安装ANTs和检查配准效果。 下载全文PDF
Alex您好! 关于“使用ANTs进行MRI图像配准”中功能到标准空间的配准部分,我猜只写了几百个功能像volume中的一个volume进行了从功能到个体结构到标准空间的配准,并未提到原始功能图像的配准。我尝试在个体功能到个体结构配准时用单个volum配个体功能的映射矩阵(.mat)但出来的结果图未有图像。所以请问具体要怎么做或者我哪里出错了? 用的命令: antsRegistrationSyN.sh -d 3 -f 22-T2_restore_brain.nii.gz -m func_1.nii.gz -t r -o 22-f2a antsApplyTransforms -d 3 -i 22-func.nii.gz -o test.nii.gz -r 22-T2w_restore_brain.nii.gz -t 22-f2a0GenericAffine.mat 此外,这里用到的是刚体配准,我一直认为它不会改变体素大小,但结果显示功能体素大小在配准后和结构一样,这个怎么解释呢? 期待您的回复! 非常感谢:D 回复
Alex您好!
关于“使用ANTs进行MRI图像配准”中功能到标准空间的配准部分,我猜只写了几百个功能像volume中的一个volume进行了从功能到个体结构到标准空间的配准,并未提到原始功能图像的配准。我尝试在个体功能到个体结构配准时用单个volum配个体功能的映射矩阵(.mat)但出来的结果图未有图像。所以请问具体要怎么做或者我哪里出错了?
用的命令:
antsRegistrationSyN.sh -d 3 -f 22-T2_restore_brain.nii.gz -m func_1.nii.gz -t r -o 22-f2a
antsApplyTransforms -d 3 -i 22-func.nii.gz -o test.nii.gz -r 22-T2w_restore_brain.nii.gz -t 22-f2a0GenericAffine.mat
此外,这里用到的是刚体配准,我一直认为它不会改变体素大小,但结果显示功能体素大小在配准后和结构一样,这个怎么解释呢?
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