还想请教一下，如果我想在abagen这里用xcp_d的内置分区保证我后面的分析匹配，比如想用schaefer400图谱，我应该怎么做呢？我尝试下载了图谱，但是一般给的分区模板的信息都和文档里说的不一样 回复
我不太清楚你具体遇到了什么问题。因为我没有实际看过xcp_d内置的分区文件是什么情况（我xcp_d用的也不多），我印象中好像是fs_LR空间的。如果xcp_d内置的分区和abagen要求的不一样，就需要进行相应的转换。比如将分区从fs_LR空间转换到fsaverage。如果是我的话，我会直接考虑用Yeo实验室提供的fsaverage空间的分区文件，而不是xcp_d内置的，只要脑区能对应上就行。 回复
好嘞谢谢！是我在xcp_d处理的时候没有选择别的分区模板，使用了它自己内置的模板，包括了这些4S1056Parcels’, ‘4S156Parcels’, ‘4S256Parcels’, ‘4S356Parcels’, ‘4S456Parcels’, ‘4S556Parcels’, ‘4S656Parcels’, ‘4S756Parcels’, ‘4S856Parcels’, ‘4S956Parcels’, ‘Glasser’, ‘Gordon’, ‘HCP’, ‘MIDB’, ‘MyersLabonte’, ‘Tian，所以在选择abagen的时候想要跟原本的对应，处理起来就比较麻烦 回复
xcp_d内置的分区有些是合并了多个分区模板构成的，比如4S1056Parcels，但是abagen可能没办法直接用这些分区模板。比如要得到4S1056Parcels的基因表达矩阵，我个人觉得比较简单的做法可能是，先找出组成这个分区的子分区模板有哪些，比如有的子分区是MNI空间的，有的是fsaverage空间，然后分别放入abagen进行分析，最后再把不同分区的结果合并在一起。 回复
还想请教一下，如果我想在abagen这里用xcp_d的内置分区保证我后面的分析匹配，比如想用schaefer400图谱，我应该怎么做呢？我尝试下载了图谱，但是一般给的分区模板的信息都和文档里说的不一样
我不太清楚你具体遇到了什么问题。因为我没有实际看过xcp_d内置的分区文件是什么情况（我xcp_d用的也不多），我印象中好像是fs_LR空间的。如果xcp_d内置的分区和abagen要求的不一样，就需要进行相应的转换。比如将分区从fs_LR空间转换到fsaverage。如果是我的话，我会直接考虑用Yeo实验室提供的fsaverage空间的分区文件，而不是xcp_d内置的，只要脑区能对应上就行。
好嘞谢谢！是我在xcp_d处理的时候没有选择别的分区模板，使用了它自己内置的模板，包括了这些4S1056Parcels’, ‘4S156Parcels’, ‘4S256Parcels’, ‘4S356Parcels’, ‘4S456Parcels’, ‘4S556Parcels’, ‘4S656Parcels’, ‘4S756Parcels’, ‘4S856Parcels’, ‘4S956Parcels’, ‘Glasser’, ‘Gordon’, ‘HCP’, ‘MIDB’, ‘MyersLabonte’, ‘Tian，所以在选择abagen的时候想要跟原本的对应，处理起来就比较麻烦
xcp_d内置的分区有些是合并了多个分区模板构成的，比如4S1056Parcels，但是abagen可能没办法直接用这些分区模板。比如要得到4S1056Parcels的基因表达矩阵，我个人觉得比较简单的做法可能是，先找出组成这个分区的子分区模板有哪些，比如有的子分区是MNI空间的，有的是fsaverage空间，然后分别放入abagen进行分析，最后再把不同分区的结果合并在一起。
或者是在xcp_d处理的时候外接HCPex的图谱，但是xcp_d外接图谱得用BIDS格式，也挺麻烦，找不到做好的，还得自己整
可以根据XCP_D处理后的dense数据去提取其他分区图谱的时间序列和计算相关矩阵，这些步骤并没有必要一定要用XCP_D。