Alex的学习笔记

使用ggseg进行可视化

总结使用ggseg包对分区统计结果进行可视化的基本方法。

使用Network-Based Statistics (NBS)方法对连接矩阵进行多重比较校正。

介绍ICA-AROMA的基本原理和使用方法。

使⽤bootstrap和randomization的方法对（皮尔逊）相关系数进⾏统计推断，并与使用数学模型的方法进⾏比较。

CBIG_fMRI_Preproc是Thomas Yeo实验室提供的一个处理静息态fMRI数据的pipeline，这里记录一下如何使用这个pipeline来处理静息态fMRI数据。

freeview可以方便地对体积和皮层文件进行可视化。在实际运用中，往往需要查看大量被试的数据，如果每个被试手动进行可视化，会耗费大量时间。一个解决方案是，批量生成所有被试的图片，然后查看这些图片即可。这里就介绍如何批量生成图片的方法。

cat_batch_cat.sh是CAT12工具包提供的一个通过命令行调用CAT12分析数据的Bash脚本，学习一下这个脚本。

总结R for Data Science一书中学到的一些函数用法。