本文介绍在Matlab环境下使用NODDI工具包计算NDI和ODI微结构指标的基本方法。
分类: MRI
使用ComBat方法校正站点效应
本文介绍在R环境下使用ComBat方法校正站点效应(site effect)。
使用FreeSurfer 7.4.1分割海马亚区
本文介绍在FreeSurfer 7.4.1中进行海马亚区分割(和杏仁核亚区分割)的方法。
使用GNU Parallel进行FreeSurfer并行计算
本文介绍如何使用GNU Parallel进行多个被试的FreeSurfer并行计算。
在Ubuntu 22.04中安装AFNI 24.2
本文记录在Ubuntu 22.04中安装AFNI 24.2的过程。
在Ubuntu 22.04中安装FSL 6.0.7
本文记录在Ubuntu 22.04中安装FSL 6.0.7的过程。
使用LQT分析脑损伤数据
本文介绍LQT(Lesion Quantification Toolkit)的基本用法。LQT是一个MATLAB工具包,主要用于度量局部脑损伤引起的白质失连接(disconnection)。
使用fsbrain对FreeSurfer数据进行读写和可视化
本文介绍使用R环境下的fsbrain包对FreeSurfer格式的数据进行读写和可视化的基本方法。