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Alex的学习笔记

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分类: MRI

使用NODDI工具包分析DWI数据

作者 Alex发布于 2024-11-232024-11-23分类 MRI标签 DWI、microstructure于使用NODDI工具包分析DWI数据留下评论

本文介绍在Matlab环境下使用NODDI工具包计算NDI和ODI微结构指标的基本方法。

使用ComBat方法校正站点效应

作者 Alex发布于 2024-11-04分类 MRI标签 data harmonization于使用ComBat方法校正站点效应留下评论

本文介绍在R环境下使用ComBat方法校正站点效应(site effect)。

使用FreeSurfer 7.4.1分割海马亚区

作者 Alex发布于 2024-08-312025-03-27分类 MRI标签 amygdala nuclei、hippocampal subfields于使用FreeSurfer 7.4.1分割海马亚区留下评论

本文介绍在FreeSurfer 7.4.1中进行海马亚区分割(和杏仁核亚区分割)的方法。

使用GNU Parallel进行FreeSurfer并行计算

作者 Alex发布于 2024-08-02分类 MRI标签 FreeSurfer、Parallel Computing于使用GNU Parallel进行FreeSurfer并行计算留下评论

本文介绍如何使用GNU Parallel进行多个被试的FreeSurfer并行计算。

在Ubuntu 22.04中安装AFNI 24.2

作者 Alex发布于 2024-07-19分类 MRI标签 AFNI于在Ubuntu 22.04中安装AFNI 24.2留下评论

本文记录在Ubuntu 22.04中安装AFNI 24.2的过程。

在Ubuntu 22.04中安装FSL 6.0.7

作者 Alex发布于 2024-07-18分类 MRI标签 FSL于在Ubuntu 22.04中安装FSL 6.0.7留下评论

本文记录在Ubuntu 22.04中安装FSL 6.0.7的过程。

使用LQT分析脑损伤数据

作者 Alex发布于 2024-04-04分类 MRI标签 Lesion使用LQT分析脑损伤数据有 4 条评论

本文介绍LQT(Lesion Quantification Toolkit)的基本用法。LQT是一个MATLAB工具包,主要用于度量局部脑损伤引起的白质失连接(disconnection)。

使用fsbrain对FreeSurfer数据进行读写和可视化

作者 Alex发布于 2023-10-22分类 MRI标签 FreeSurfer、visualization于使用fsbrain对FreeSurfer数据进行读写和可视化留下评论

本文介绍使用R环境下的fsbrain包对FreeSurfer格式的数据进行读写和可视化的基本方法。

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