本文介绍使用R环境下的fsbrain包对FreeSurfer格式的数据进行读写和可视化的基本方法。
分类： MRI
使用BrainSMASH进行空间相关
在进行不同脑图间的关联分析的时候，需要考虑到脑图本身的空间自相关性（spatial autocorrelation）。这里介绍使用Python环境下的BrainSMASH包进行空间相关的基本方法。
使用abagen包提取AHBA基因表达数据
介绍使用Python环境下abagen包提取AHBA（Allen Human Brain Atlas）基因表达数据的基本方法。
DARTEL工具包的基本用法
使用SPM12里的Dartel Tools构建组水平灰白质模板、实现个体与模板之间的配准和相互转换等。
CAT拾遗3
如何在CAT12中使用自定义的组织概率图谱（Tissue Probability Maps，TPM）和DARTEL模板进行分析。
使用SPM12进行组织分割
简介使用SPM12进行组织分割的三种方法。
使用CPM构建预测模型
介绍使用Connectome-based Predictive Modeling（CPM）方法构建预测模型的基本步骤。
使用FreeSurfer分割海马亚区
使用FreeSurfer 6.0分割海马亚区的基本步骤。