总结使用DPABI的统计模块对MRI图像进行统计分析的基本方法,并与SPM的统计结果进行简单对比。
分类: MRI
使用DPARSF处理静息态fMRI数据
DPARSF是一个基于SPM的静息态fMRI数据处理软件,提供了流行的静息态 fMRI 数据处理方案。DPARSF在其官网上有视频教程,这里是我自己的学习总结,理解不一定准确。
使用BrainNet Viewer进行可视化
BrainNet Viewer是一个基于MATLAB的可视化工具,适合于展示基于图论的脑网络分析结果。
如何去除fcMRI头动噪声
分享一篇2018年发表在Nature Protocols上的文章,该文章提出了一个去除functional connectivity MRI(fcMRI)中头动噪声的最佳方案。
使用SimTB生成模拟fMRI数据
SimTB是一个生成模拟fMRI数据的MATLAB工具包,这里介绍它的原理和基本用法。
实现TFCE校正的三种方法
TFCE(Threshold Free Cluster Enhancement)是一种比较流行的多重比较校正方法,这里介绍实现TFCE校正的三种方法,包括FSL的randomise命令、基于SPM的TFCE和pTFCE插件。
在GIFT中标记成分
总结GIFT工具包中提供的与标记独立成分有关的三个小工具。标记成分是为了找到我们感兴趣的成分,为后续分析做准备。
CAT拾遗2
总结如何使用CAT进行基于皮层的形态学分析(Surface-Based Morphometry),包括估计皮层指标(厚度、沟回指数、沟深、复杂度等)、平滑和重采样、统计分析和可视化。