在GIFT中标记成分

《在GIFT中标记成分》有15个想法

1. 您好 看了您的这个笔记，想请教您一下，创建模板所需的两个文件我都有了，自定义脑网络模板的具体实施步骤您可以告知一下吗，谢谢您！

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   1. 如果你已经有模板文件和标签文件，直接放到GIFT安装目录下的icatb_templates文件夹下就可以使用了。

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      1. 非常感谢您，解决问题了！

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      2. 想请问哪个自定义脑网络模板如何制作呀，例如FindLab Atlas，我已经下载到了这14个网络的nii文件了，但是gift中自带的rsn网络模版txt文件上的信息是什么意思呢，如果我想做一个类似的模版该怎么做呀，谢谢。

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         1. 每行表示每个网络的名称以及包含哪些成分。

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2. “选择每个被试的 design matrix 文件，可以直接使用 SPM 生成的 SPM.mat 文件”这个SPM.mat文件时什么文件，是如何做的呢？

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   1. SPM.mat包含任务态fMRI的设计矩阵，如果你用SPM分析任务态数据就会有这个文件，你可以用SPM.mat来筛选与任务刺激有关的成分。

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3. 老师您好，我想把每一个component提取出来做成一个mask，然后把这些mask做成一个atlas，不知道有没有方法可以实现呀，谢谢老师。

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   1. 好像没有现成的软件或者代码。可能困难的地方在于如何选择阈值和处理不同成分mask的重叠的部分，因为成分本身是连续的。

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4. 您好，我想使用yeo的七网络模板但是好像没有标签文件。这个标签文件是需要我自己制作嘛还是，yeo的模板有标签文件只是我没有找到

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   1. 是的，需要一个nii文件，一个txt标签文件。yeo的模板是一个3D文件，也就是说所有的网络在一个图像里，需要把yeo模板转换成一个4D文件，每个图像是一个网络。

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5. 谢谢老师！有个很白痴的问题〒▽〒我下载到的yeo模板文件都是nii.gz这个是不是压缩包呀，windows系统怎么解压这类文件呀

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   1. 是的，gz表示压缩格式。我还是真不太清楚Windows上解压的软件，因为我的工作环境是Linux，但是应该通常的解压软件都可以吧。如果不行的话，除了装软件，也可以找一个在线的解压工具。

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6. 你好老师问一下，我想做默认网络DMN的筛选，我有模板文件，从Neurosynth上下载的，但是标签文件找不到，请问标签文件在哪里下载？

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   1. 标签文件就是一个txt结尾的文本文件，需要自己做一个，你可以参考GIFT自带的标签文件的内容。

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