学习TBSS实现细节并根据自己的需求进行修改。
分类: MRI
使用ggseg进行可视化
总结使用ggseg包对分区统计结果进行可视化的基本方法。
使用NBS方法进行多重比较校正
使用Network-Based Statistics (NBS)方法对连接矩阵进行多重比较校正。
使用ICA-AROMA去除头动噪声
介绍ICA-AROMA的基本原理和使用方法。
使用CBIG_fMRI_Preproc处理静息态fMRI数据
CBIG_fMRI_Preproc是Thomas Yeo实验室提供的一个处理静息态fMRI数据的pipeline,这里记录一下如何使用这个pipeline来处理静息态fMRI数据。
使用freeview批量生成图片
freeview可以方便地对体积和皮层文件进行可视化。在实际运用中,往往需要查看大量被试的数据,如果每个被试手动进行可视化,会耗费大量时间。一个解决方案是,批量生成所有被试的图片,然后查看这些图片即可。这里就介绍如何批量生成图片的方法。
解析cat_batch_cat.sh脚本
cat_batch_cat.sh是CAT12工具包提供的一个通过命令行调用CAT12分析数据的Bash脚本,学习一下这个脚本。
使用SPM12进行MRI图像配准
使用SPM12将fMRI图像配准到MNI模板。